Wat is de samenhang met het systeem van management informatie (MIS)?

In wezen is de Balanced scorecard als rapportageinstrument te zien als onderdeel van het systeem van management informatie. Sommige organisaties laten een systeem van management informatie naast de Balanced scorecard bestaan. In deze situaties bevat het systeem van management informatie vooral de financiële gegevens in een meer gedetailleerde vorm of bevat het vooral informatie ten behoeve van de operationele aansturing. In het eerste geval is de kern van de Balanced scorecard niet begrepen (prestaties in de overige drie perspectieven voorspellen de toekomstige prestaties in het financiële perspectief) of hecht de organisatie nog (te) veel aan de oude vertrouwde financiële cijfers. In het tweede geval wordt management informatie en operationele informatie nog teveel met elkaar verward.